Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms