Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HKR1P10072 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HKR1P10072 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HKR1P10072 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms