Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI3P10071 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI3P10071 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI3P10071 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI3P10071 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI3P10071 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI3P10071 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI3P10071 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI3P10071 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI3P10071 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI3P10071 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI3P10071 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI3P10071 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI3P10071 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI3P10071 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI3P10071 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI3P10071 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI3P10071 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI3P10071 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI3P10071 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI3P10071 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI3P10071 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI3P10071 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI3P10071 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI3P10071 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI3P10071 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI3P10071 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI3P10071 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI3P10071 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI3P10071 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI3P10071 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI3P10071 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI3P10071 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms