Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBSLP0DN79 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms