Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4BP0C0L5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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