Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSLP07711 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSLP07711 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms