Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCAP05165 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCAP05165 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCAP05165 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCCAP05165 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCCAP05165 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCCAP05165 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCCAP05165 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCCAP05165 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms