Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POP4O95707 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POP4O95707 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POP4O95707 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms