Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF1O95521 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms