Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAPBO95292 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VAPBO95292 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VAPBO95292 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms