Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPO95166 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms