Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPM2O94759 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPM2O94759 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPM2O94759 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPM2O94759 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPM2O94759 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPM2O94759 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPM2O94759 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPM2O94759 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPM2O94759 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPM2O94759 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPM2O94759 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPM2O94759 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPM2O94759 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPM2O94759 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPM2O94759 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms