Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNKO75909 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNKO75909 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCNKO75909 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CCNKO75909 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCNKO75909 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCNKO75909 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCNKO75909 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCNKO75909 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCNKO75909 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCNKO75909 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCNKO75909 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCNKO75909 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNKO75909 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCNKO75909 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCNKO75909 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCNKO75909 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCNKO75909 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCNKO75909 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCNKO75909 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCNKO75909 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCNKO75909 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCNKO75909 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms