Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms