Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG13O75143 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG13O75143 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG13O75143 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG13O75143 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG13O75143 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG13O75143 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG13O75143 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG13O75143 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG13O75143 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG13O75143 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG13O75143 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG13O75143 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG13O75143 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG13O75143 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG13O75143 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG13O75143 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG13O75143 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG13O75143 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG13O75143 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG13O75143 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms