Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNSO60931 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNSO60931 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNSO60931 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNSO60931 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNSO60931 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNSO60931 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNSO60931 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNSO60931 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNSO60931 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNSO60931 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNSO60931 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNSO60931 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNSO60931 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNSO60931 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNSO60931 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNSO60931 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNSO60931 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNSO60931 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms