Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
ABCC9O60706 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
ABCC9O60706 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms