Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLIN1O60240 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms