Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1GO43497 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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