Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBDO15205 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBDO15205 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBDO15205 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBDO15205 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBDO15205 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBDO15205 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBDO15205 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBDO15205 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBDO15205 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBDO15205 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBDO15205 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBDO15205 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBDO15205 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBDO15205 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBDO15205 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBDO15205 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UBDO15205 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBDO15205 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UBDO15205 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBDO15205 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UBDO15205 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBDO15205 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBDO15205 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBDO15205 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBDO15205 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBDO15205 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBDO15205 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms