Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms