Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms