Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms