Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DBX1A6NMT0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms