Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms