Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms