Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDD3Q9Y3P4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDD3Q9Y3P4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDD3Q9Y3P4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDD3Q9Y3P4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDD3Q9Y3P4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms