Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2J1Q9Y385 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2J1Q9Y385 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2J1Q9Y385 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2J1Q9Y385 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2J1Q9Y385 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2J1Q9Y385 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2J1Q9Y385 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE2J1Q9Y385 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE2J1Q9Y385 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE2J1Q9Y385 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE2J1Q9Y385 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE2J1Q9Y385 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE2J1Q9Y385 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBE2J1Q9Y385 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
UBE2J1Q9Y385 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE2J1Q9Y385 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE2J1Q9Y385 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE2J1Q9Y385 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE2J1Q9Y385 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE2J1Q9Y385 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE2J1Q9Y385 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE2J1Q9Y385 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE2J1Q9Y385 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE2J1Q9Y385 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE2J1Q9Y385 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE2J1Q9Y385 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms