Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W6

TDRKH, Tudor and KH domain-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRKHQ9Y2W6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRKHQ9Y2W6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TDRKHQ9Y2W6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TDRKHQ9Y2W6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRKHQ9Y2W6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRKHQ9Y2W6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRKHQ9Y2W6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRKHQ9Y2W6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRKHQ9Y2W6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRKHQ9Y2W6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRKHQ9Y2W6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRKHQ9Y2W6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRKHQ9Y2W6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRKHQ9Y2W6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRKHQ9Y2W6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRKHQ9Y2W6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRKHQ9Y2W6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms