Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UPB1Q9UBR1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPB1Q9UBR1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UPB1Q9UBR1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPB1Q9UBR1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPB1Q9UBR1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UPB1Q9UBR1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UPB1Q9UBR1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UPB1Q9UBR1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPB1Q9UBR1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPB1Q9UBR1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UPB1Q9UBR1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPB1Q9UBR1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPB1Q9UBR1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPB1Q9UBR1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UPB1Q9UBR1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UPB1Q9UBR1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPB1Q9UBR1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPB1Q9UBR1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPB1Q9UBR1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPB1Q9UBR1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UPB1Q9UBR1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms