Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL39Q9NYK5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL39Q9NYK5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms