Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HELLSQ9NRZ9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HELLSQ9NRZ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
HELLSQ9NRZ9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HELLSQ9NRZ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HELLSQ9NRZ9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
HELLSQ9NRZ9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HELLSQ9NRZ9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HELLSQ9NRZ9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms