Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS4

Prss29, Serine protease 29, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss29Q99MS4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,24
Prss29Q99MS4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,24
Prss29Q99MS4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,24
Prss29Q99MS4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16,51■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16,51■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16,51■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16,51■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16,51■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16,5■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16,49■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16,49■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,49■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,48■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,48■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,48■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16,48■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16,47■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,47■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,47■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,46■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,46■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,46■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,46■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,46■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16,46■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,46■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,46■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,46■□□□□ 0,23
Prss29Q99MS4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,46■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,45■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16,45■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16,45■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,44■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16,44■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,44■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,43■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,43■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,43■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,43■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,42■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16,42■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,41■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16,41■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16,41■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,41■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16,41■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,4■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Prss29Q99MS4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,39■□□□□ 0,21
Prss29Q99MS4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16,39■□□□□ 0,21
Prss29Q99MS4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16,39■□□□□ 0,21
Prss29Q99MS4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,39■□□□□ 0,21
Prss29Q99MS4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
Prss29Q99MS4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
Prss29Q99MS4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16,38■□□□□ 0,21
Prss29Q99MS4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16,38■□□□□ 0,21
Prss29Q99MS4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16,38■□□□□ 0,21
Prss29Q99MS4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16,38■□□□□ 0,21
Prss29Q99MS4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,8 ms