Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LGMNQ99538 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LGMNQ99538 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LGMNQ99538 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGMNQ99538 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms