Protein–RNA interactions for Protein: Q96I24

FUBP3, Far upstream element-binding protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP3Q96I24 LPCAT1-202ENST00000475622 5610 ntTSL 517.32■□□□□ 0.365e-7■■■■□ 25.6
FUBP3Q96I24 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.255e-7■■■■□ 25.6
FUBP3Q96I24 WDR82-204ENST00000487402 4333 ntTSL 210.06□□□□□ -0.83e-6■■■■□ 25.6
FUBP3Q96I24 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.361e-7■■■■□ 25.6
FUBP3Q96I24 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.331e-6■■■■□ 25.6
FUBP3Q96I24 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.249e-7■■■■□ 25.6
FUBP3Q96I24 LGR5-206ENST00000550851 4095 ntTSL 211.72□□□□□ -0.539e-7■■■■□ 25.6
FUBP3Q96I24 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.035e-7■■■■□ 25.5
FUBP3Q96I24 FOXO1-203ENST00000636651 1773 ntTSL 511.27□□□□□ -0.615e-7■■■■□ 25.5
FUBP3Q96I24 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.199e-8■■■■□ 25.5
FUBP3Q96I24 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.361e-8■■■■□ 25.5
FUBP3Q96I24 SDE2-201ENST00000272091 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.41e-6■■■■□ 25.5
FUBP3Q96I24 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.123e-7■■■■□ 25.5
FUBP3Q96I24 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.383e-7■■■■□ 25.5
FUBP3Q96I24 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.513e-7■■■■□ 25.5
FUBP3Q96I24 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.872e-10■■■■□ 25.4
FUBP3Q96I24 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.162e-10■■■■□ 25.4
FUBP3Q96I24 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.082e-10■■■■□ 25.4
FUBP3Q96I24 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.163e-6■■■■□ 25.4
FUBP3Q96I24 AKIRIN1-204ENST00000531822 718 ntTSL 59.7□□□□□ -0.862e-17■■■■□ 25.4
FUBP3Q96I24 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 25.4
FUBP3Q96I24 LPIN2-201ENST00000261596 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.678e-10■■■■□ 25.3
FUBP3Q96I24 AKAP2-202ENST00000374525 6866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.98e-10■■■■□ 25.3
FUBP3Q96I24 PALM2-AKAP2-202ENST00000374530 7507 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.938e-10■■■■□ 25.3
FUBP3Q96I24 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.64e-8■■■■□ 25.3
FUBP3Q96I24 PDS5B-203ENST00000450460 5246 ntTSL 1 (best)2.54□□□□□ -24e-8■■■■□ 25.3
FUBP3Q96I24 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.314e-7■■■■□ 25.3
FUBP3Q96I24 MBTD1-203ENST00000415868 5099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.794e-7■■■■□ 25.3
FUBP3Q96I24 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 25.3
FUBP3Q96I24 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.253e-8■■■■□ 25.3
FUBP3Q96I24 AASDHPPT-205ENST00000534152 5145 ntTSL 1 (best)2.87□□□□□ -1.953e-8■■■■□ 25.3
FUBP3Q96I24 DTD1-203ENST00000618693 695 ntTSL 514.74□□□□□ -0.051e-10■■■■□ 25.2
FUBP3Q96I24 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.291e-10■■■■□ 25.2
FUBP3Q96I24 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.821e-10■■■■□ 25.2
FUBP3Q96I24 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.211e-7■■■■□ 25
FUBP3Q96I24 ATMIN-206ENST00000566488 5343 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.911e-7■■■■□ 25
FUBP3Q96I24 ATMIN-202ENST00000539819 2434 ntTSL 26.81□□□□□ -1.321e-7■■■■□ 25
FUBP3Q96I24 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.351e-7■■■■□ 25
FUBP3Q96I24 TACC1-212ENST00000521050 491 ntTSL 1 (best)18.1■□□□□ 0.493e-6■■■■□ 25
FUBP3Q96I24 TACC1-216ENST00000521642 493 ntTSL 1 (best)17.17■□□□□ 0.343e-6■■■■□ 25
FUBP3Q96I24 TACC1-222ENST00000522752 944 ntTSL 1 (best)14.39□□□□□ -0.113e-6■■■■□ 25
FUBP3Q96I24 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.213e-6■■■■□ 25
FUBP3Q96I24 TACC1-223ENST00000522904 1724 ntTSL 513.42□□□□□ -0.263e-6■■■■□ 25
FUBP3Q96I24 TACC1-204ENST00000518415 3011 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.853e-6■■■■□ 25
FUBP3Q96I24 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.531e-8■■■■□ 25
FUBP3Q96I24 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.911e-8■■■■□ 25
FUBP3Q96I24 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.636e-10■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.116e-10■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 LDLR-201ENST00000252444 5337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.16□□□□□ -0.141e-7■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 POU2F1-201ENST00000271411 13945 ntTSL 1 (best)6.49□□□□□ -1.379e-7■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.619e-7■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.639e-7■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 POU2F1-203ENST00000367865 14332 ntTSL 24.74□□□□□ -1.659e-7■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.669e-7■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 POU2F1-208ENST00000443275 12939 ntTSL 1 (best)4.66□□□□□ -1.669e-7■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.739e-7■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.312e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.172e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 LARP4B-212ENST00000614908 1826 ntTSL 421.44■■□□□ 1.022e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.722e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.722e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 ASGR1-206ENST00000573596 2083 ntTSL 518.92■□□□□ 0.622e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.562e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.422e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 NPEPL1-209ENST00000533788 899 ntTSL 517.1■□□□□ 0.332e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 DAPK1-217ENST00000496522 579 ntTSL 216.95■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 DAPK1-206ENST00000469067 2499 ntTSL 216.93■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 PNPLA3-202ENST00000406117 1480 ntTSL 216.14■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 NPEPL1-207ENST00000529976 4684 ntTSL 1 (best)15.92■□□□□ 0.142e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.122e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 DAPK1-210ENST00000472344 548 ntTSL 515.56■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 GCNT2-215ENST00000489819 409 ntTSL 1 (best)15.49■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 NPEPL1-206ENST00000527587 4633 ntTSL 515.09■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.071e-11■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.282e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.422e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 SOX5-204ENST00000441133 638 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.472e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.482e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 CHD2-205ENST00000625662 5127 ntTSL 512.05□□□□□ -0.482e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 DAPK1-213ENST00000491893 4186 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 GCNT2-205ENST00000410107 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 DAPK1-219ENST00000622514 5772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 LARP4B-201ENST00000316157 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 DAPK1-209ENST00000472284 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 STK36-207ENST00000440309 4721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 GCNT2-214ENST00000489225 932 ntTSL 1 (best)10.89□□□□□ -0.672e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 STK36-204ENST00000419433 2093 ntTSL 210.75□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 PHC3-209ENST00000484068 913 ntTSL 410.61□□□□□ -0.712e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 MAGOH-204ENST00000495868 695 ntTSL 1 (best)10.59□□□□□ -0.711e-11■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 IK-201ENST00000417647 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.762e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 STK36-202ENST00000392105 4821 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.812e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 LIN52-205ENST00000555028 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.842e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 DAPK1-212ENST00000489291 4334 ntTSL 1 (best)9.72□□□□□ -0.852e-6■■■■□ 24.9
FUBP3Q96I24 SOX5-215ENST00000545921 2589 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.872e-6■■■■□ 24.9
Retrieved 100 of 4,568 protein–RNA pairs in 153 ms