Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGSM3Q96HU1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM3Q96HU1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM3Q96HU1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGSM3Q96HU1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms