Protein–RNA interactions for Protein: Q969X1

TMBIM1, Protein lifeguard 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMBIM1Q969X1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMBIM1Q969X1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMBIM1Q969X1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMBIM1Q969X1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMBIM1Q969X1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMBIM1Q969X1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMBIM1Q969X1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMBIM1Q969X1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMBIM1Q969X1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMBIM1Q969X1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMBIM1Q969X1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMBIM1Q969X1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMBIM1Q969X1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMBIM1Q969X1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMBIM1Q969X1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMBIM1Q969X1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMBIM1Q969X1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMBIM1Q969X1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMBIM1Q969X1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMBIM1Q969X1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMBIM1Q969X1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMBIM1Q969X1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMBIM1Q969X1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMBIM1Q969X1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMBIM1Q969X1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMBIM1Q969X1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMBIM1Q969X1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMBIM1Q969X1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMBIM1Q969X1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMBIM1Q969X1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMBIM1Q969X1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMBIM1Q969X1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMBIM1Q969X1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMBIM1Q969X1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMBIM1Q969X1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMBIM1Q969X1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMBIM1Q969X1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMBIM1Q969X1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMBIM1Q969X1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms