Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF3AQ92664 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF3AQ92664 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3AQ92664 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3AQ92664 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3AQ92664 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF3AQ92664 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3AQ92664 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3AQ92664 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3AQ92664 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF3AQ92664 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3AQ92664 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF3AQ92664 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3AQ92664 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3AQ92664 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF3AQ92664 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3AQ92664 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3AQ92664 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3AQ92664 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF3AQ92664 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3AQ92664 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3AQ92664 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF3AQ92664 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3AQ92664 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3AQ92664 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3AQ92664 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF3AQ92664 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3AQ92664 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3AQ92664 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF3AQ92664 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3AQ92664 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3AQ92664 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF3AQ92664 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3AQ92664 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms