Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM46DQ8NEK8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM46DQ8NEK8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM46DQ8NEK8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM46DQ8NEK8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM46DQ8NEK8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM46DQ8NEK8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM46DQ8NEK8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM46DQ8NEK8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM46DQ8NEK8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM46DQ8NEK8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM46DQ8NEK8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM46DQ8NEK8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM46DQ8NEK8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM46DQ8NEK8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM46DQ8NEK8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM46DQ8NEK8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM46DQ8NEK8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM46DQ8NEK8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM46DQ8NEK8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM46DQ8NEK8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM46DQ8NEK8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms