Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACBD4Q8NC06 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACBD4Q8NC06 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD4Q8NC06 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD4Q8NC06 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 457.4 ms