Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIML1Q8N9V2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIML1Q8N9V2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIML1Q8N9V2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIML1Q8N9V2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRIML1Q8N9V2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIML1Q8N9V2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIML1Q8N9V2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIML1Q8N9V2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms