Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PAF1Q8N7H5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAF1Q8N7H5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAF1Q8N7H5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms