Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC13Q8IYE1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC13Q8IYE1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC13Q8IYE1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms