Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CKAP2LQ8IYA6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CKAP2LQ8IYA6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CKAP2LQ8IYA6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CKAP2LQ8IYA6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CKAP2LQ8IYA6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CKAP2LQ8IYA6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CKAP2LQ8IYA6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CKAP2LQ8IYA6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CKAP2LQ8IYA6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CKAP2LQ8IYA6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CKAP2LQ8IYA6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CKAP2LQ8IYA6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CKAP2LQ8IYA6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CKAP2LQ8IYA6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms