Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC103Q8IW40 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC103Q8IW40 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms