Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ube2oQ6ZPJ3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ube2oQ6ZPJ3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ube2oQ6ZPJ3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ube2oQ6ZPJ3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ube2oQ6ZPJ3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ube2oQ6ZPJ3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ube2oQ6ZPJ3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ube2oQ6ZPJ3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ube2oQ6ZPJ3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ube2oQ6ZPJ3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ube2oQ6ZPJ3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ube2oQ6ZPJ3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ube2oQ6ZPJ3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ube2oQ6ZPJ3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ube2oQ6ZPJ3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ube2oQ6ZPJ3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ube2oQ6ZPJ3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ube2oQ6ZPJ3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ube2oQ6ZPJ3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ube2oQ6ZPJ3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ube2oQ6ZPJ3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ube2oQ6ZPJ3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ube2oQ6ZPJ3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ube2oQ6ZPJ3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ube2oQ6ZPJ3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ube2oQ6ZPJ3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ube2oQ6ZPJ3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ube2oQ6ZPJ3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ube2oQ6ZPJ3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ube2oQ6ZPJ3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ube2oQ6ZPJ3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ube2oQ6ZPJ3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ube2oQ6ZPJ3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ube2oQ6ZPJ3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ube2oQ6ZPJ3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ube2oQ6ZPJ3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ube2oQ6ZPJ3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ube2oQ6ZPJ3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ube2oQ6ZPJ3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ube2oQ6ZPJ3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ube2oQ6ZPJ3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ube2oQ6ZPJ3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ube2oQ6ZPJ3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ube2oQ6ZPJ3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ube2oQ6ZPJ3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ube2oQ6ZPJ3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ube2oQ6ZPJ3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ube2oQ6ZPJ3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ube2oQ6ZPJ3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ube2oQ6ZPJ3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ube2oQ6ZPJ3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ube2oQ6ZPJ3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms