Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP1Q6WKZ4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP1Q6WKZ4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms