Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SARM1Q6SZW1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SARM1Q6SZW1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SARM1Q6SZW1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SARM1Q6SZW1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SARM1Q6SZW1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SARM1Q6SZW1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SARM1Q6SZW1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SARM1Q6SZW1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SARM1Q6SZW1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SARM1Q6SZW1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SARM1Q6SZW1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SARM1Q6SZW1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SARM1Q6SZW1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SARM1Q6SZW1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SARM1Q6SZW1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SARM1Q6SZW1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SARM1Q6SZW1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SARM1Q6SZW1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SARM1Q6SZW1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SARM1Q6SZW1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SARM1Q6SZW1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms