Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MICBQ29980 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MICBQ29980 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MICBQ29980 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MICBQ29980 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MICBQ29980 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MICBQ29980 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MICBQ29980 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MICBQ29980 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MICBQ29980 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MICBQ29980 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MICBQ29980 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MICBQ29980 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MICBQ29980 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MICBQ29980 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MICBQ29980 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MICBQ29980 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MICBQ29980 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MICBQ29980 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MICBQ29980 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MICBQ29980 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MICBQ29980 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MICBQ29980 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MICBQ29980 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MICBQ29980 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MICBQ29980 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MICBQ29980 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MICBQ29980 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MICBQ29980 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MICBQ29980 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MICBQ29980 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MICBQ29980 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MICBQ29980 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MICBQ29980 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MICBQ29980 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MICBQ29980 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MICBQ29980 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MICBQ29980 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MICBQ29980 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MICBQ29980 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MICBQ29980 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MICBQ29980 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MICBQ29980 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MICBQ29980 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MICBQ29980 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MICBQ29980 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MICBQ29980 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MICBQ29980 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MICBQ29980 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MICBQ29980 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MICBQ29980 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MICBQ29980 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MICBQ29980 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MICBQ29980 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MICBQ29980 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MICBQ29980 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MICBQ29980 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MICBQ29980 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MICBQ29980 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MICBQ29980 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MICBQ29980 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MICBQ29980 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MICBQ29980 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MICBQ29980 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MICBQ29980 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MICBQ29980 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MICBQ29980 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MICBQ29980 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MICBQ29980 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MICBQ29980 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MICBQ29980 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MICBQ29980 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MICBQ29980 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MICBQ29980 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MICBQ29980 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MICBQ29980 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MICBQ29980 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MICBQ29980 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MICBQ29980 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MICBQ29980 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MICBQ29980 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MICBQ29980 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MICBQ29980 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MICBQ29980 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MICBQ29980 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MICBQ29980 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MICBQ29980 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MICBQ29980 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MICBQ29980 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MICBQ29980 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MICBQ29980 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MICBQ29980 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MICBQ29980 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MICBQ29980 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MICBQ29980 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MICBQ29980 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MICBQ29980 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MICBQ29980 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MICBQ29980 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MICBQ29980 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms