Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLPPQ16740 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLPPQ16740 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLPPQ16740 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLPPQ16740 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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